Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMC2Q13753 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms