Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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