Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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