Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
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