Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms