Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms