Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms