Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms