Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZBED6P86452 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms