Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms