Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms