Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms