Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ACTBP60709 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ACTBP60709 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ACTBP60709 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ACTBP60709 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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