Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms