Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DEFB1P60022 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms