Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSCP56915 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSCP56915 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.2 ms