Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms