Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A3P48751 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms