Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSOP43234 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSOP43234 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSOP43234 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSOP43234 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSOP43234 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSOP43234 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSOP43234 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSOP43234 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSOP43234 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSOP43234 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSOP43234 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSOP43234 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSOP43234 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CTSOP43234 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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CTSOP43234 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CTSOP43234 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSOP43234 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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