Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFC1P35251 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFC1P35251 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFC1P35251 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFC1P35251 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFC1P35251 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFC1P35251 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFC1P35251 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFC1P35251 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms