Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms