Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCM3P25205 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCM3P25205 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MCM3P25205 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MCM3P25205 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
MCM3P25205 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MCM3P25205 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms