Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms