Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS6KB1P23443 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KB1P23443 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms