Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 LDHAL6FP-201ENST00000405916 1082 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC115618.3-201ENST00000623114 425 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRHP20396 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 CST2-201ENST00000304725 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 TMEM161B-AS1-204ENST00000504636 1039 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC123595.2-201ENST00000607854 549 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRHP20396 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 FCER1A-201ENST00000368114 765 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 IFNWP19-201ENST00000438727 566 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 TRAIP-202ENST00000469027 1145 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC096919.1-201ENST00000472730 652 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRHP20396 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms