Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NELFEP18615 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NELFEP18615 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELFEP18615 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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