Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF3P15923 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF3P15923 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF3P15923 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF3P15923 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF3P15923 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF3P15923 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF3P15923 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF3P15923 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF3P15923 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF3P15923 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF3P15923 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF3P15923 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF3P15923 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF3P15923 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF3P15923 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms