Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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