Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms