Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RALAP11233 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RALAP11233 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RALAP11233 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RALAP11233 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RALAP11233 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RALAP11233 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RALAP11233 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RALAP11233 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RALAP11233 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RALAP11233 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RALAP11233 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RALAP11233 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms