Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTMAP06454 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTMAP06454 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms