Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP104O60308 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP104O60308 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms