Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB3O43889 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB3O43889 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB3O43889 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB3O43889 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB3O43889 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB3O43889 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms