Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TO15178 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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