Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCF2LO15068 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCF2LO15068 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCF2LO15068 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms