Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms