Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
HELTA6NFD8 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms