Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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