Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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