Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms