Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRBP1Q9P2E9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms