Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms