Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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CENPMQ9NSP4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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CENPMQ9NSP4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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CENPMQ9NSP4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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CENPMQ9NSP4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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CENPMQ9NSP4 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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CENPMQ9NSP4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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CENPMQ9NSP4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CENPMQ9NSP4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CENPMQ9NSP4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CENPMQ9NSP4 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CENPMQ9NSP4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPMQ9NSP4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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