Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SERINC1Q9NRX5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms