Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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