Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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