Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms