Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZC3H12CQ9C0D7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms