Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TM6SF1Q9BZW5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TM6SF1Q9BZW5 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM6SF1Q9BZW5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TM6SF1Q9BZW5 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM6SF1Q9BZW5 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM6SF1Q9BZW5 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TM6SF1Q9BZW5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TM6SF1Q9BZW5 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TM6SF1Q9BZW5 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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TM6SF1Q9BZW5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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TM6SF1Q9BZW5 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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TM6SF1Q9BZW5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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