Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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